Fakultete vykdomi tyrimai susiję su prioritetinės universiteto mokslo krypties „Tvarus augimas ir darni sociokultūrinė raida“. Dėl trijų mokslo sričių – socialinių ir humanitarinių mokslų bei menų – integracijos fakulteto MTEPI pasižymi plačiu tyrimų tematikų spektru, metodų įvairove ir tarpdiscipliniškumu.